A OnePlus One korábban még CyanogenModdal érkezett, és a ROM fejlesztője, Kirk McMaster szerint épp ez a szoftver vezetett a OnePlus sikeréhez.
Nem sokkal később viszont a Cyanogen aláírt egy megállapodást, ami miatt kizárólag Micromax eszközökön lehetett rajta Indiában. Itt viszont a OnePlus is terjeszkedett, és ez végül gondokhoz, sőt, a OnePlus One átmeneti betiltásához vezetett.
A OnePlus a helyzetet egy saját rendszerrel oldotta meg, ami az aktuális modellen is futó OxygenOS lett. A Cyanogen ennek ellenére minden OnePlus One-t frissített a Lollipop-alapú CM12-re.
A OnePlus 2 már OxygenOS rendszerrel érkezett, viszont a felhasználóknak hamarosan új lehetőségeik is lesznek.
A jelek szerint egy rootolás után (ez sajnos garanciavesztéssel járhat) telepíthető lesz a Cyanogen ROM-ja. Ami azt illeti, az Android 5.1-re építő CM 12.1-et és az Android 6.0-ra alapozó CM 13-at is fel lehet majd tenni.
